ردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی جدایه های ایرانی Fig badnavirus-1 بر اساس ژن تولید کننده آنزیم پروتئاز
نویسندگان
چکیده مقاله:
بادنا ویروس یک انجیر (Fig badnavirus -1) متعلق به خانواده Caulimoviridae و جنس Badnavirus و یکی از شایع ترین عوامل ویروسی همراه با بیماری موزائیک انجیر در انجیرکاری های جهان می باشد. طی فصول زراعی سال های 1391 تا 1393، در مجموع تعداد 392 نمونه برگی علائم دار و بدون علائم ویروسی از انجیر کار های مختلف موجود در 9 استان کشور جمع آوری شد. نمونه ها توسط آزمون سرولوژیکی Dot Immunobinding Assay (DIBA) و با استفاده از آنتی سرم اختصاصی ویروس موزائیک انجیر مورد بررسی قرار گرفتند. وجود ویروس در نمونه های آلوده توسط آزمون های مولکولی مورد تایید قرار گرفت. برای این منظور، DNA کل از نمونه های آلوده استخراج و با استفاده از آغازگر اختصاصی برای ژن پروتئاز، قطعه ای به طول تقریبی 1055 جفت باز تکثیر شد. بمنظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه ها، محصول پی سی آر نمونه های آلوده به FBV-1 توسط آنزیم EcoRI در آزمون RFLP مورد هضم آنزیمی قرار گرفتند. پس از مشخص شدن توالی نوکلئوتیدی منطقه تکثیر شده 9 جدایه FBV-1 مربوط استان های مختلف، توالی های با رس شمارهای KU314932-40 در بانک ژن ثبت شدند. نتایج همردیف سازی توالی ها نشان داد جدایه های ایرانی در هر یک از سطوح نوکلئوتیدی یا اسید آمینه ای به میزان 99-98% مشابه بودند. در بررسی تبارزایی بر مبنای توالی نوکلئوتیدی جدایه های مورد بررسی در دو گروه قرار گرفتند و جدایه های ایرانی مستقل از جدایه آمریکا در گروه مجزا قرار گرفتند. فیلوژنی بر مبنای توالی اسید آمینه درخت فیلوژنتیکی متفاوتی را نشان داد
منابع مشابه
ردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی ژن پروتئین پوششی سه جدایه ایرانی ویروس آبله آلو (Plum pox virus)
ویروس آبله آلو (Plum pox virus, PPV) یکی از خسارتزاترین ویروس‌های درختان میوه هسته‌دار در دنیا می باشد. به منظور ردیابی و بررسی خصوصیات مولکولی جدایه‌های‌ایرانی PPV، طی سال‌های زراعی 93-91، تعداد 130 نمونه برگی درختان هسته دار با علایم ویروسی از باغات درختان هسته دار استان‌های اردبیل ، مازندران و تهران جمع‌آوری شدند. ردیابی ویروس با روش‌های ELISA DAS-، ایمونوبلات و همچنین RT-PCR با آغازگرهای ا...
متن کاملردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی ژن پروتئین پوششی سه جدایه ایرانی ویروس آبله آلو (plum pox virus)
ویروس آبله آلو (plum pox virus, ppv) یکی از خسارتزاترین ویروس های درختان میوه هسته دار در دنیا می باشد. به منظور ردیابی و بررسی خصوصیات مولکولی جدایه های ایرانی ppv، طی سال های زراعی 93-91، تعداد 130 نمونه برگی درختان هسته دار با علایم ویروسی از باغات درختان هسته دار استان های اردبیل ، مازندران و تهران جمع آوری شدند. ردیابی ویروس با روش های elisa das-، ایمونوبلات و همچنین rt-pcr با آغازگر های ا...
متن کاملتایپینگ جدایه های ایرانی پاستورلا مولتوسیدای گوسفندی و طیور ، بر اساس 4 ژن (L1-L4) بیوسنتز کننده هسته خارجی LPS
پاستورلا مولتوسیدا یک پاتوژن گرم منفی است که موجب بیماری در حیوان و انسان میشود. وبای مرغی و پاستوریولوز گوسفندی از عفونتهای مهم پاستورلامولتوسیدا میباشد که ضرر و زیانهای اقتصادی زیادی را به صنعت دامپروری وارد میسازد. عوامل حدت مختلفی در این باکتری شناسایی شدهاند که لیپوپلیساکارید جزء مهمترین فاکتورهای بیماریزای آن محسوب میشوند. هدف از تایپینگ LPS بررسی اختلاف...
متن کاملشناسایی ژن های مولد مقاومت آنتی بیوتیکی در جدایه های بالینی کلبسیلا پنومونیه تولید کننده بتالاکتاماز IMP-1 وTEM
متن کامل
تعیین توالی و بررسی خصوصیات مولکولی ژن بتا 1 و 4 اندوگلوکاناز سویه Bacillus subtilis B5d
این پژوهش به منظور تعیین برخی ویژگی‌های کاتالیتیکی و خصوصیات مولکولی ژن کدکننده آنزیم بتا 1و4 اندوگلوکاناز در سویهBacillus subtilis B5d انجام شد. ژن کدکننده این آنزیم در سویه B5d توسط آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و در پایگاه اطلاعاتی NCBI ثبت شد. تجزیه توالی حاصله و رسم درخت فیلوژنی با استفاده از نرم‌افزار Vector NTI و Mega.4 انجام شد. براساس نتایج حاصله قطعه تعیین توالیشده شامل 794 ...
متن کاملردیابی و بررسی روابط تبارزایی جدایه‌های ایرانی ویروس موزائیک انجیر بر اساس ژن کد کننده نوکلئوکپسید پروتئین
ویروس موزائیک انجیر Fig mosaic emaravirus (FMV)یکی از مهمترین عوامل ایجاد کننده بیماری موزائیک انجیر می باشد. این تحقیق به منظور شناسایی و ردیابی FMV در مناطق مختلف کشور و همچنین مطالعه روابط تبارزایی بر مبنای ژن کد کننده پروتئین نوکلئوکپسید (NP) صورت پذیرفت. برای این منظور تعداد 54 نمونه برگ انجیر دارای علایم موزائیکی و کلروز از مناطق مختلف کشت انجیر در شمال، مرکز و جنوب ایران جمع آوری گردید...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 84 شماره شماره 1
صفحات 119- 130
تاریخ انتشار 2016-08-22
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023